Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fubp3Q3TIX6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fubp3Q3TIX6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms