Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc69Q3TCJ8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms