Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3KNL4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3KNL4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3KNL4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms