Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nlrp1aQ2LKU9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms