Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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Tdrd9Q14BI7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
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Tdrd9Q14BI7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd9Q14BI7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd9Q14BI7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms