Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gli2Q0VGT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gli2Q0VGT2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gli2Q0VGT2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms