Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc162pQ0VG85 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms