Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Itgb8Q0VBD0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Itgb8Q0VBD0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms