Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kndc1Q0KK55 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kndc1Q0KK55 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms