Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cnnm1Q0GA42 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cnnm1Q0GA42 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms