Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tgm3Q08189 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tgm3Q08189 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms