Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CbfbQ08024 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms