Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pou6f1Q07916 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pou6f1Q07916 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms