Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Col9a2Q07643 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Col9a2Q07643 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms