Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cdx4Q07424 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms