Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gdf9Q07105 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms