Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Siah1bQ06985 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms