Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smarcad1Q04692 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms