Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cxcr5Q04683 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cxcr5Q04683 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms