Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Kcnb1Q03717 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms