Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Crisp3Q03402 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Crisp3Q03402 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms