Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cacna1sQ02789 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms