Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GscQ02591 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GscQ02591 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GscQ02591 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GscQ02591 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GscQ02591 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms