Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Top2aQ01320 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms