Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VegfaQ00731 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
VegfaQ00731 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms