Protein–RNA interactions for Protein: P98199

Atp8b2, Phospholipid-transporting ATPase ID, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b2P98199 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp8b2P98199 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atp8b2P98199 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms