Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
VldlrP98156 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VldlrP98156 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms