Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VegfdP97946 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VegfdP97946 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VegfdP97946 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms