Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 3,329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brca2P97929 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms