Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cry1P97784 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cry1P97784 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms