Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tarbp2P97473 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms