Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Vps45P97390 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vps45P97390 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms