Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Frg1P97376 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg1P97376 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms