Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Otx2P80206 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Otx2P80206 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms