Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr4P70658 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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