Protein–RNA interactions for Protein: P70194

Clec4f, C-type lectin domain family 4 member F, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4fP70194 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Clec4fP70194 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms