Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Traf5P70191 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Traf5P70191 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Traf5P70191 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms