Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PtnP63089 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PtnP63089 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PtnP63089 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms