Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gabrb3P63080 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabrb3P63080 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms