Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vbp1P61759 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms