Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tdrd6P61407 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms