Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Actr1aP61164 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms