Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Klf16P58334 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf16P58334 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms