Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dpf3P58269 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms