Protein–RNA interactions for Protein: P56726

Smo, Smoothened homolog, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmoP56726 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SmoP56726 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmoP56726 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmoP56726 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SmoP56726 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SmoP56726 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SmoP56726 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SmoP56726 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmoP56726 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmoP56726 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SmoP56726 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms