Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lim2P56563 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lim2P56563 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lim2P56563 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms