Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd38P56528 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd38P56528 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms