Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Usp5P56399 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Usp5P56399 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Usp5P56399 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms