Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CdaP56389 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CdaP56389 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CdaP56389 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CdaP56389 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CdaP56389 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CdaP56389 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CdaP56389 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CdaP56389 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CdaP56389 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CdaP56389 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CdaP56389 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CdaP56389 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CdaP56389 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CdaP56389 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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