Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pex2P55098 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pex2P55098 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pex2P55098 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms